nioch.ru

Федеральное государственное бюджетное учреждение науки
Новосибирский институт органической химии им. Н.Н. Ворожцова
Сибирского отделения Российской академии наук

Лаборатория Магнитного Резонанса Биомолекулярных Систем

Наименование проекта: Многочастотный электронный парамагнитный резонанс (ЭПР) для биохимических исследований

№ договора:14.W03.31.0034

Наименование ВУЗа: Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Новосибирский институт органической химии им. Н.Н. Ворожцова Сибирского отделения Российской академии наук

Области научных исследований: Химия

Цель проекта: Целью проекта является развитие и применение передовых методов спектроскопии электронного парамагнитного резонанса (ЭПР) к актуальным задачам в области биохимии и биомедицины, имеющие принципиальную значимость для развития методов диагностики и разработки стратегий лечения ряда социально важных заболеваний, таких как болезни сердечно-сосудистой системы, болезнь Альцгеймера, онкологические заболевания и др. 
Задача проекта:Основной задачей данного проекта является создание высокотехнологичной ЭПР лаборатории мирового уровня, имеющей в своем распоряжении самый современный приборный парк с максимальной функциональностью, и укомплектованной высококвалифицированными кадрами.

Bowman_Michael

Майкл Кейт Боуман

Гражданство: США

Ученые степень и звание: Кандидат химических наук, Профессор

Занимаемая должность: Профессор химии

Области научных интересов: Электронный парамагнитный резонанс, спиновая релаксация, биофизика, перенос электрона

Научные достижения:

Профессор Боуман является лидером в разработке и применении импульсных методов в ЭПР спектроскопии для следующего круга задач: структурная и функциональная характеристика реакционноспособных химических соединений, интермедиатов, биомолекулярных систем, определение расстояний и геометрических параметров в биомолекулах и биологических системах, измерение переноса энергии, релаксация и реакционная способность.
1975 - Определение структуры комплекса электрона и молекулярного стекла,
1978 - Первые исследования хлорофилла и фотосинтетических систем методом спинового эха,
1979 - Первые исследования нитроксильных радикалов в жидкостях при комнатной температуре методом спинового эха,
1980 - Разработка первого импульсного ЭПР спектрометра,
1982 - Установил, что перенос электрона происходит из возбужденного синглетного состояния при фотосинтезе в бактериях,
1986 - Первые исследования спин-меченных белков при физиологических концентрациях и температурах методом спин-электронного эха,
1988 - In Vivo ЭПР измерения на живом сердце крысы,
1988 - ЭПР-измерения с Фурье преобразованием кинетики электронного переноса в жидкости,
1990 - Изучение дефекта внедрения атома никеля в кристалл алмаза,
1995 - Разработка модели ширины линии и аналитических методов для HYSCORE спектроскопии в неориентированных твердых телах,
1996 - Описание белков, содержащих железо, методом HYSCORE и импульсного ЭПР,
2002 - Определение механизма ингибирования цитохрома b6f металлами,
2004 - Описание нового гема Х в цитохроме b6f,
2005 - Определение структуры тритильных радикалов в растворе,
2007 - Разработан метод описания структуры семихинонового интермедиата в цитохроме bc1 методом ЭПР,
2010 - Измерено изменение структуры каталитической РНК в присутствии ионов металлов,
2012 - Обнаружен новый метод присоединения для ингибиторов II типа белков P450,
2013 - Разработан новый импульсный метод для оксиметрических ЭПР измерений,
2013 - Определена локализация интермедиатов энзимов в цитохроме bc1 и NO-синтазы методом ЭПР-релаксации,
2015 - Охарактеризовал свойства самоструктурирующихся агрегатов тритильных радикалов методом динамической поляризации ядер,
2016 - Охарактеризовал электронную спиновую динамику триарилметильных радикалов в процессах динамической ядерной поляризации,
2016 - Открыл новый биомаркер для разобщающейся NO синтазы

Награды:


1988 - награда R&D-100 Award за ЭПР-измерения с Фурье преобразованием кинетики электронного переноса в жидкости,
2003 - серебряная медаль по химии за вклад в области ЭПР в химии,
2016 - международная премия имени Завойского за достижения в области магнитного резонанса за выдающиеся приложения электронного парамагнитного резонанса во всех областях науки.

Основные публикации:

  1. Bowman MK, Chen H, Maryasov AG. Fourier-Transform EPR. In: Goldfarb D, Stoll S, editors. Emagres. 6. 15 SEP 2017 ed. Chichester: John Wiley & Sons, Ltd; 2017. p. 387-406.
  2. Lockart MM, Rodriguez CA, Atkins WM, Bowman MK. CW EPR parameters reveal cytochrome P450 ligand binding modes. J Inorg Biochem. 2018;183:157-64.
  3. Chen H, Maryasov AG, Rogozhnikova OY, Trukhin DV, Tormyshev VM, Bowman MK. Electron spin dynamics and spin-lattice relaxation of trityl radicals in frozen solutions. PCCP. 2016;18(36):24954-65.
  4. Trukhin DV, Rogozhnikova OY, Troitskaya TI, Vasiliev VG, Bowman MK, Tormyshev VM. Facile and High-Yielding Synthesis of TAM Biradicals and Monofunctional TAM Radicals. Synlett. 2016;27(6):893-9.
  5. Krzyaniak MD, Cruce AA, Vennam P, Lockart M, Berka V, Tsai AL, et al. The tetrahydrobiopterin radical interacting with high- and low-spin heme in neuronal nitric oxide synthase - A new indicator of the extent of NOS coupling. Free Radic Biol Med. 2016;101:367-77.
  6. Conner KP, Schimpf AM, Cruce AA, McLean KJ, Munro AW, Frank DJ, et al. Strength of Axial Water Ligation in Substrate-Free Cytochrome P450s Is Isoform Dependent. Biochemistry. 2014;53(9):1428-34.
  7. Epel B, Bowman MK, Mailer C, Halpern HJ. Absolute Oxygen R-1e Imaging In Vivo with Pulse Electron Paramagnetic Resonance. Magn Reson Med. 2014;72(2):362-8.
  8. Trukhan SN, Yudanov VF, Tormyshev VM, Rogozhnikova OY, Trukhin DV, Bowman MK, et al. Hyperfine interactions of narrow-line trityl radical with solvent molecules. J Magn Reson. 2013;233:29-36.
  9. Vennam PR, Fisher N, Krzyaniak MD, Kramer DM, Bowman MK. A Caged, Destabilized, Free Radical Intermediate in the Q-Cycle. ChemBioChem. 2013;14(14):1745-53.
  10. Conner KP, Vennam P, Woods CM, Krzyaniak MD, Bowman MK, Atkins WM. 1,2,3-Triazole-Heme Interactions in Cytochrome P450: Functionally Competent Triazole-Water-Heme Complexes. Biochemistry. 2012;51(32):6441-57.
  11. Kim NK, Bowman MK, DeRose VJ. Precise mapping of RNA tertiary structure via nanometer distance measurements with double electron-electron resonance spectroscopy. J Am Chem Soc. 2010;132(26):8882-4.
  12. Cape JL, Bowman MK, Kramer DM. A semiquinone intermediate generated at the Qo site of the cytochrome bc1 complex: importance for the Q-cycle and superoxide production. P Natl Acad Sci USA. 2007;104(19):7887-92.
  13. Cape JL, Bowman MK, Kramer DM. Understanding the cytochrome bc complexes by what they don't do. The Q-cycle at 30. Trends Plant Sci. 2006;11(1):46-55.
  14. Bowman MK, Mailer C, Halpern HJ. The solution conformation of triarylmethyl radicals. J Magn Reson. 2005;172(2):254-67.
  15. Halpern HJ, Jaffe DR, Nguyen TD, Haraf DJ, Spencer DP, Bowman MK, et al. Measurement of bioreduction rates of cells with distinct responses to ionizing radiation and cisplatin. Biochim Biophys Acta. 1991;1093 (2-3):121-4.
  16. Isoya J, Kanda H, Norris JR, Tang J, Bowman MK. Fourier-transform and continuous-wave EPR studies of nickel in synthetic diamond: Site and spin multiplicity. Phys Rev B Condens Matter. 1990;41(7):3905-13.


 

Сотрудники

Сотрудник Должность Кабинет Телефон Телефон вн. email Публикации
по годампо видупо If
1 Боуман Майкл Кейт зав. лабораторией(дф-мн)
2 Колосова Наталия Гориславовна гнс(дбн)
3 Карпова Галина Георгиевна гнс(дхн)
4 Гришин Юрий Акимович внс(дф-мн)
5 Федин Матвей Владимирович внс(дф-мн)
6 Годовикова Татьяна Сергеевна внс(дхн)
7 Грайфер Дмитрий Маратович внс(дхн)
8 Кирилюк Игорь Анатольевич внс(кхн) 207 330-73-87 2-74 Этот адрес электронной почты защищён от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра.
9 Маматюк Виктор Ильич внс(кхн) 304 НТК 330-69-60 3-92 Этот адрес электронной почты защищён от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра.
10 Вебер Сергей Леонидович снс(кф-мн)
11 Крумкачева Олеся Анатольевна снс(кф-мн)
12 Марьясов Александр Георгиевич снс(кф-мн) 107 НТК Этот адрес электронной почты защищён от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра.
13 Булыгин Константин Николаевич снс(кхн)
14 Мажукин Дмитрий Геннадьевич снс(кхн) 317 НТК, 335 330-68-52 2-56, 2-41 Этот адрес электронной почты защищён от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра.
15 Малыгин Алексей Аркадьевич снс(кхн)
16 Морозов Денис Александрович снс(кхн) 208 330-73-87 4-11 Этот адрес электронной почты защищён от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра.
17 Полиенко Юлия Федоровна снс(кхн) 206 330-73-87 4-12 Этот адрес электронной почты защищён от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра.
18 Рогожникова Ольга Юрьевна снс(кхн) 313 330-49-81 3-34 Этот адрес электронной почты защищён от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра.
19 Тормышев Виктор Михайлович снс(кхн) 325 330-49-81 3-00 Этот адрес электронной почты защищён от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра.
20 Трухин Дмитрий Владимирович снс(кхн) 223 330-49-81 4-02 Этот адрес электронной почты защищён от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра.
21 Шернюков Андрей Владимирович снс(кхн) 102 330-55-04 3-91 Этот адрес электронной почты защищён от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра.
22 Рудницкая Екатерина Александровна нс(кбн)
23 Исаев Николай Павлович нс(кф-мн)
24 Ломанович Константин Александрович нс(кф-мн) 107 НТК Этот адрес электронной почты защищён от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра.
25 Пархоменко Дмитрий Александрович нс(кф-мн) 242 330-55-04 2-05 Этот адрес электронной почты защищён от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра.
26 Половяненко Дмитрий Николаевич нс(кф-мн) 202 НТК 330-96-61 3-29 Этот адрес электронной почты защищён от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра.
27 Аврамчук Татьяна Витальевна нс(кхн)
28 Веньяминова Алия Гусейн кызы нс(кхн)
29 Добрынин Сергей Александрович нс(кхн) 207 330-73-87 2-74 Этот адрес электронной почты защищён от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра.
30 Журко Ирина Фридриховна нс(кхн) 207 330-73-87 2-74 Этот адрес электронной почты защищён от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра.
31 Мещанинова Мария Ивановна нс(кхн)
32 Таратайко Андрей Игоревич нс(кхн) 231 330-73-87 4-10 Этот адрес электронной почты защищён от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра.
33 Асанбаева Наргиз Байузаковна мнс 106 НИЦ Этот адрес электронной почты защищён от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра.
34 Иванов Михаил Юрьевич мнс
35 Калетина Полина Михайловна мнс 243 330-55-04 2-05 Этот адрес электронной почты защищён от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра.
36 Куцейкин Сергей Сергеевич мнс
37 Лисицкий Владимир Александрович мнс
38 Овчеренко Сергей Сергеевич мнс 106 НТК 330-94-32 3-54 Этот адрес электронной почты защищён от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра.
39 Очкасова Анастасия Сергеевна мнс
40 Полюхов Даннил Максимович мнс
41 Порываев Артем Сергеевич мнс
42 Тюменцев Михаил Алексеевич мнс
43 Черкасов Сергей Александрович мнс 243 330-55-04 2-05 Этот адрес электронной почты защищён от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра.
44 Чинак Ольга Александровна мнс
45 Серпокрылова Инна Юрьевна мнс(кхн)
46 Чубаров Алексей Сергеевич мнс(кхн)
47 Тимофеев Иван Олегович ведущий инженер
48 Троицкая Татьяна Ивановна ведущий технолог 325 330-49-81 3-00 Этот адрес электронной почты защищён от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра.
Студенты
49 Спицына Анна Сергеевна лаборант 106 НТК 330-94-32 3-54 Этот адрес электронной почты защищён от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра.
50 Хорошунова Юлия Владиславовна лаборант 208 330-73-87 4-11 Этот адрес электронной почты защищён от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра.


Список статей по мегагранту за 2018 год:





1) Novel Biradicals for Direct Excitation Highfield Dynamic Nuclear Polarization
S. Bothe, J. Nowag, V. Klimavicius, M.M. Hoffmann, T.I. Troitskaya, E.V. Amosov, V.M. Tormyshev, I. Kirilyuk, A. Taratayko, A.A. Kuzhelev, D. Parkhomenko, E.G. Bagryanskaya, T. Gutmann, G. Buntkowsky.// J. Phys. Chem. C 2018, 122 (21), 11422-11432, DOI:10.1021/acs.jpcc.8b02570, IF=4.484 / Q1

Альметрики: 


2) In vivo extracellular pH mapping of tumours using electron paramagnetic resonance, Denis A. Komarov, Yuki Ichikawa, Kumiko Yamamoto, Neil J. Stewart, Shingo Matsumoto, Hironobu Yasui, Igor A. Kirilyuk, Valery V. Khramtsov, Osamu Inanamib and Hiroshi Hirata, Anal. Chem., 2018, 90 (23), pp 13938–13945 doi: 10.1021/acs.analchem.8b03328 IF= 6.042 / Q1

Альметрики: 



3) Aradical containing injectable in-situ-oleogelandemulgelforprolongedin-vivooxygen measurements with CW EPR, Lisa Lampp, Olga Yu. Rogozhnikova, Dmitry V. Trukhin, Victor M. Tormyshev, Michael K. Bowman, Nllathamby Devasahayam, Murali C. Krishna, Karsten Mäder, Peter Imming, Free Radical Biology and Medicine, 2018 , DOI: 10.1016/j.freeradbiomed.2018.10.442, IF=6.02 / Q1

4) Electron-Spin Relaxation of Triarylmethyl Radicals in Glassy Trehalose A.A. Kuzhelev, O.A. Krumkacheva, I.O. Timofeev, V.M. Tormyshev, M.V. Fedin, E.G. Bagryanskaya, Applied Magnetic Resonance, 2018, 49 (11), pp 1171-1180 doi:10.1007/s00723-018-1023-0, IF=0.835 / Q4

5) Radical Polymerization of Radical-Labeled Monomers: The Triarylmethyl-Based Radical Monomer as an Example, Mariya V. Edeleva, Sylvain R. A. Marque, Olga Yu. Rogozhnikova, Victor M. Tormyshev, Tatiana I. Troitskaya, Elena G. Bagryanskaya, Journal of polymer science Part A: Polymer chemistry 2018, 56 (23), pp.2656-2664) DOI: 10.1002/pola.29249, IF=2.588 / Q2

6) Changes in Retinal Glial Cells with Age and during Development of Age Related Macular Degeneration, D.V. Telegina, O.S. Kozhevnikova, N.G. Kolosova, Biochemistry (Moscow), 2018, 83, (9), pp. 1009-1017, DOI: 10.1134/S000629791809002X, IF=1.724 / Q4

7) Pulse EPR of Triarylmethyl Probes: New Approach for Investigation of Molecular Motions in Soft Matter, Andrey A. Kuzhelev, Olesya A. Krumkacheva, Mikhail Yu. Ivanov, Sergey A. Prikhod’ko, Nicolay Yu. Adonin, Victor M. Tormyshev, Michael K. Bowman, Matvey V. Fedin, Elena G. Bagryanskaya, J. Phys. Chem. B 2018, 122 (36), 8624−8630, DOI: 10.1021/acs.jpcb.8b07714, IF=3.146 / Q2

8) Oxygen-induced leakage of spin polarization in Overhauser-enhanced magnetic resonance imaging: application for oximetry in tumors, A.A. Gorodetskii, T.D. Eubank, B. Driesschaert, M. Poncelet, E. Ellis, V.V. Khramtsov, A.A. Bobko, Journal of Magnetic Resonance, 2018, 297:42-50. doi: 10.1016/j.jmr.2018.10.005, IF=2.586 / Q2

9) Alterations of hippocampal neurogenesis during development of Alzheimer's disease-like pathology in OXYS rats, Ekaterina A. Rudnitskaya, Tatiana A. Kozlova, Alena O.Burnyasheva, Natalyia G. Kolosova, Natalia A. Stefanova, Experimental Gerontology 115 (2019) 32-45 doi: 10.1016/j.exger.2018.11.008, IF= 3.224 / Q2

10) Synthesis of paramagnetic spiropyran derivatives, Andrey I. Taratayko, Tatyana V. Rybalova, Vladimir A. Reznikov, Chemistry of Heterocyclic Compounds 2018, 54(10), 981-983, DOI: 10.1007/s10593-018-2375-y, IF= 1.201 / Q3

11) Versatile approach to activation of alkoxyamine homolysis by 1,3-dipolar cycloaddition for efficient and safe nitroxide mediated polymerization, Mariya Edeleva, Denis Morozov, Dmitriy Parkhomenko, Yulia Polienko, Anna Iurchenkova, Igor Kirilyik, Elena Bagryanskaya, Chem. Commun., 2019, 55, 190-193, DOI: 10.1039/C8CC08541B IF=6.29 / Q1

12) The human ribosome can interact with the abasic site in mRNA via a specific peptide of the uS3 protein located near the mRNA entry channel , Anastasia S. Ochkasova, Maria I. Meschaninova, Aliya G. Venyaminova, Anton V. Ivanov, Dmitri M. Graifer, Galina G. Karpova, Biochimie 2019, 158, 117-125, DOI:10.1016/j.biochi.2018.12.015, IF=/ Q2

---------------

 





Публикации сотрудников подразделения (БД НИОХ СО РАН) 1 (2018 - 2020 )

Монографии, главы в научных книгах, учебные пособия


    2020
  1. P. Kaletina, M. Edeleva
    Chapter 3 - Fluorinated initiators, mediators, and solvents in controlled radical polymerization
    Opportunities for Fluoropolymers, Synthesis, Characterization, Processing, Simulation and Recycling, Progress in Fluorine Science, 2020, Pages 69-88 doi:10.1016/B978-0-12-821966-9.00003-1

Обзоры, статьи в научных журналах

  1. T.V. Popova, O.A. Krumkacheva, A.S. Burmakova, A.S. Spitsyna, O.D. Zakharova, V.Al. Lisitskiy, I.A. Kirilyuk, V.N. Silnikov, M. Bowman, E. Bagryanskaya, T. Godovikova
    Protein modification by thiolactone homocysteine chemistry: a multifunctionalized human serum albumin theranostic
    RSC Med. Chem., 2020, Accepted Manuscript doi:10.1039/C9MD00516A
  2. D.M. Polyukhov, S. Krause, V. Bon, A.S. Poryvaev, S. Kaskel, M.V. Fedin
    Structural Transitions of the Metal-Organic Framework DUT-49(Cu) upon Physi- and Chemisorption Studied by in Situ Electron Paramagnetic Resonance Spectroscopy
    J. Phys. Chem. Lett. 2020, 11, XXX, 5856-5862 doi:10.1021/acs.jpclett.0c01705, IF=6.71
  3. N. A. Muraleva ,N. A. Stefanova,N. G. Kolosova
    SkQ1 Suppresses the p38 MAPK Signaling Pathway Involved in Alzheimer's Disease-Like Pathology in OXYS Rats
    Antioxidants 2020, 9(8), 676 doi:10.3390/antiox9080676, IF=5.13
  4. E.A. Kulikova, O.S. Kozhevnikova, A.V. Kulikov, N.G. Kolosova, T.M. Khomenko, K.P. Volcho, N.F. Salakhutdinov, D.V. Telegina
    Alterations of STEP46 and STEP61 Expression in the Rat Retina with Age and AMD-Like Retinopathy Development
    Int. J. Mol. Sci. 2020, 21(15), 5182 doi:10.3390/ijms21155182, IF=4.556
  5. N. Sannikova, I. Timofeev, E. Bagryanskaya, M. Bowman, M. Fedin, O. Krumkacheva
    Electron Spin Relaxation of Photoexcited Porphyrin in Water-Glycerol Glass
    Molecules 2020, 25(11), 2677 doi:10.3390/molecules25112677, IF=3.267
  6. E.G. Kovaleva, L.S. Molochnikov, D. Tambasova, A. Marek, M. Chestnut, V.A. Osipova, D.O. Antonov, I.A. Kirilyuk, A. Smirnov
    Electrostatic Properties of Inner Nanopore Surfaces of Anodic Aluminum Oxide Membranes upon High Temperature Annealing Revealed by EPR of pH-sensitive Spin Probes and Labels
    Journal of Membrane Science, V. 604, 1 June 2020, 118084 doi:10.1016/j.memsci.2020.118084, IF=7.183
  7. A.S. Poryvaev, D.M. Polyukhov, M.V. Fedin
    Mitigation of Pressure-Induced Amorphization in Metal–Organic Framework ZIF-8 upon EPR Control
    ACS Appl. Mater. Interfaces 2020, V. 12, N 14, Pp 16655-16661 doi:10.1021/acsami.0c03462, IF=8.758
  8. S. Dobrynin, S. Kutseikin, D. Morozov, O. Krumkacheva, A. Spitsyna, Yu. Gatilov, V. Silnikov, G. Angelovski, M.K. Bowman, I. Kirilyuk, A. Chubarov
    Human Serum Albumin Labelled with Sterically-Hindered Nitroxides as Potential MRI Contrast Agents
    Molecules 2020, 25(7), 1709 doi:10.3390/molecules25071709, IF=3.267
  9. E. Zaytseva, D. Shiomi, Yu. Ten, Yu.V. Gatilov, A. Lomanovich, D.V. Stass, A.S. Bogomyakov, A. Yu, K. Sugisaki, K. Sato, T. Takui, E.G. Bagryanskaya, D. Mazhukin
    Magnetic Properties of π-Conjugated Hybrid Phenoxyl-Nitroxide Radicals with Extended π-Spin Delocalization
    The Journal of Physical Chemistry A, 2020, 124, 12, 2416-2426 doi:10.1021/acs.jpca.9b11856, IF=2.6
  10. V. Tormyshev, A. Chubarov, O. Krumkacheva, D. Trukhin, O. Rogozhnikova, A. Spitsina, A. Kuzhelev, V. Koval, M. Fedin, T. Godovikova, M. Bowman, E.G. Bagryanskaya
    Methanethiosulfonate Derivative of OX063 Trityl: a Promising and Efficient Reagent for SDSL of Proteins
    Chemistry-A European Journal, 2020, V.26, N 12, Pp 2705-2712 doi:10.1002/chem.201904587, IF=4.857
  11. I.F. Zhurko, S. Dobrynin, A.A. Gorodetskii, Yu.I. Glazachev, T.V. Rybalova, E.I. Chernyak, N. Asanbaeva, E.G. Bagryanskaya, I.A. Kirilyuk
    2-Butyl-2-tert-butyl-5,5-diethylpyrrolidine-1-oxyls: Synthesis and Properties
    Molecules 2020, 25(4), 845 doi:10.3390/molecules25040845, IF=3.267
  12. A.A. Kuzhelev, V.M. Tormyshev, V.F. Plyusnin, O.Yu. Rogozhnikova, M.V. Edeleva, S.L. Veber, E.G. Bagryanskaya
    Photochemistry of tris(2,3,5,6-tetrathiaaryl)methyl radicals in various solutions
    Phys. Chem. Chem. Phys., 2020, V. 22, N 3, Pp 1019-1026 doi:10.1039/C9CP06213K, IF=3.43

  13. 2019
  14. O.A. Krumkacheva, G.Yu. Shevelev, A.A. Lomzov, N.S. Dyrkheeva, A.A. Kuzhelev, V.V. Koval, V.M. Tormyshev, Yu.F. Polienko, M.V. Fedin, D.V. Pyshnyi, O.I. Lavrik, E.G. Bagryanskaya
    DNA complexes with human apurinic/apyrimidinic endonuclease 1: structural insights revealed by pulsed dipolar EPR with orthogonal spin labeling
    Nucleic Acids Research,2019, V. 47, N 15, Pp 7767-7780 doi:10.1093/nar/gkz620, IF=11.147
  15. S.V. Nikitin, J. Sanchez-Marquez, I.I. Oleynik, I. Oleynik, E.G. Bagryanskaya
    A screening DFT study of the para-substituent effect on local hyper-softness in bis(phenoxy-imine) titanium complexes to get insights about their catalytic activity in ethylene polymerization
    Molecular Catalysis, 2019, V. 469, Pp 57-67 doi:10.1016/j.mcat.2019.02.024, IF=2.938
  16. A.G. Maryasov, M.K. Bowman, M.V. Fedin, S.L. Veber
    Theoretical Basis for Switching a Kramers Single Molecular Magnet by Circularly-Polarized Radiation
    Materials 2019, 12(23), 3865 doi:10.3390/ma12233865, IF=2.971
  17. A.A. Malygin, O.A. Krumkacheva, D.M. Graifer, I.O. Timofeev, A.S. Ochkasova, M.I. Meschaninova, A.G. Venyaminova, M.V. Fedin, M. Bowman, G.G. Karpova, E.G. Bagryanskaya
    Exploring the interactions of short RNAs with the human 40S ribosomal subunit near the mRNA entry site by EPR spectroscopy
    Nucleic Acids Research, 2019, V. 47, N 22, Pp 11850-11860 doi:10.1093/nar/gkz1039, IF=11.147
  18. A.A. Gorodetskii, T.D. Eubank, B. Driesschaert, M. Poncelet, E. Ellis, V.V. Khramtsov, A.A. Bobko
    Development of multifunctional Overhauser-enhanced magnetic resonance imaging for concurrent in vivo mapping of tumor interstitial oxygenation, acidosis and inorganic phosphate concentration
    Scientific Reports, 2019, V. 9, Issue 1, Art.number 12093 doi:10.1038/s41598-019-48524-3, IF=4.11
  19. S.A. Dobrynin, I.A. Kirilyuk, Yu.V. Gatilov, A.A. Kuzhelev, O.A. Krumkacheva, M.V. Fedin, M.K. Bowman, E.G. Bagryanskaya
    Unexpected one-pot formation of the 1H-6a,8a-epiminotri-cyclopenta[a,c,e][8]annulene system from cyclopentanone, ammonia and dimethyl fumarate. Synthesis of highly strained polycyclic nitroxide and EPR study
    Beilstein Journal of Organic Chemistry, 2019, V. 15, Pp 2664-2670 doi:10.3762/bjoc.15.259, IF=2.595
  20. O.A. Krumkacheva, I.O. Timofeev, L.V. Politanskaya, Yu.F. Polienko, E.V. Tretyakov, O.Yu. Rogozhnikova, D.V. Trukhin, V.M. Tormyshev, A.S. Chubarov, E.G. Bagryanskaya, M.V. Fedin
    Triplet Fullerenes as Prospective Spin Labels for Nanoscale Distance Measurements by Pulsed Dipolar EPR
    Angewandte Chemie International Edition, 2019, V. 58, N 38, Pp 13271-13275 doi:10.1002/anie.201904152, IF=12.256
  21. O.A. Krumkacheva, I.O. Timofeev, L.V. Politanskaya, Yu.F. Polienko, E.V. Tretyakov, O.Yu. Rogozhnikova, D.V. Trukhin, V.M. Tormyshev, A.S. Chubarov, E.G. Bagryanskaya, M.V. Fedin
    Triplet Fullerenes as Prospective Spin Labels for Nanoscale Distance Measurements by Pulsed Dipolar EPR
    Angewandte Chemie International Edition, 2019, V. 58, N 38, Pp 13271-13275 doi:10.1002/anie.201904152, IF=12.256
  22. M.Y. Myshkin, R. Mannikko, O.A. Krumkacheva, D.S. Kulbatskii, A.O. Chugunov, A.A. Berkut, A.S. Paramonov, M.A. Shulepko, M.V. Fedin, Mi.G. Hanna, D.M. Kullmann, E.G. Bagryanskaya, A.S. Arseniev, M.P. Kirpichnikov, E.N. Lyukmanova, A.A. Vassilevski, Z.O. Shenkarev
    Cell-free expression of sodium channel domains for pharmacology studies. noncanonical spider toxin binding site in the second voltage-sensing domain of human nav1.4 channel
    Front. Pharmacol., 2019, V. 10, Art. number 953 doi:10.3389/fphar.2019.00953, IF=3.845
  23. E. Babaylova, A. Malygin, A. Gopanenko, D. Graifer, G. Karpova
    Tetrapeptide 60-63 of human ribosomal protein uS3 is crucial for translation initiation
    Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Gene Regulatory Mechanisms, 2019, V. 1862, N 9, 194411 doi:10.1016/j.bbagrm.2019.194411, IF=4.598
  24. Yu.V. Khoroshunova, D.A. Morozov, A.I. Taratayko, P.D. Gladkikh, Yu.I. Glazachev, I.A. Kirilyuk
    Synthesis of 1-azaspiro[4.4]nonan-1-oxyls via intramolecular 1,3-dipolar cycloaddition
    Beilstein Journal of Organic Chemistry, 2019, V. 15, Pp 2036-2042 doi:10.3762/bjoc.15.200, IF=2.595
  25. D. Polyukhov, A.S. Poryvaev, S.A. Gromilov, M.V. Fedin
    Precise Measurement and Controlled Tuning of Effective Window Sizes in ZIF-8 Framework for Efficient Separation of Xylenes
    Nano Letters, 2019, V. 19, N 9, Pp 6506-6510 doi:10.1021/acs.nanolett.9b02730, IF=12.279
  26. G. Audran, E. Bagryanskaya, I. Bagryanskaya, M. Edeleva, J.-P. Joly, S-R.A. Marque, A. Iurchenkova, P. Kaletina, S. Cherkasov, T.To. Hai, E. Tretyakov, S. Zhivetyeva
    How intramolecular coordination bonding (ICB) controls the homolysis of the C-ON bond in alkoxyamines
    RSC Adv., 2019,V. 9, N 44, Pp 25776-25789 doi:10.1039/C9RA05334D, IF=3.049
  27. O.A. Chinak, A.V. Shernyukov, S.S. Ovcherenko, E.A. Sviridov, V.M. Golyshev, A.S. Fomin, I.A. Pyshnaya, E.V. Kuligina, V.A. Richter, E.G. Bagryanskaya
    Structural and Aggregation Features of a Human k-Casein Fragment with Antitumor and Cell-Penetrating Properties
    Molecules 2019, 24(16), 2919 doi:10.3390/molecules24162919, IF=3.59
  28. T. Yokoyama, A. Taguchi, H. Kubota, N.J. Stewart, Sh. Matsumoto, I.A. Kirilyuk, H. Hirata
    Simultaneous T2* mapping of 14N- and 15N-labeled dicarboxy-PROXYLs using CW-EPR-based single-point imaging
    Journal of Magnetic Resonance, 2019, V. 305, Pp 122-130 doi:10.1016/j.jmr.2019.06.012, IF=2.689
  29. E. Zaytseva, I. Timofeev, O. Krumkacheva, D. Parkhomenko, D. Mazhukin, K. Sato, H. Matsuoka, T. Takui, E. Bagryanskaya
    EPR and DEER Characterization of New Mixed Weakly Coupled Nitroxide Triradicals for Molecular Three-Spin Qubits
    Applied Magnetic Resonance, 2019, V. 50, N 8, pp 967-976 doi:10.1007/s00723-019-01125-9, IF=0.78
  30. A. Ochkasova, M. Meschaninova, A. Venyaminova, A. Ivanov, D. Graifer, G. Karpova
    The human ribosome as a possible mRNA quality controller that recognizes the abasic site by protein uS3
    FEBS OPEN BIO, V. 9, Pp 163-163, Suppl. 1 Аннотация к встрече: P-11-010, WOS:000486972402108, IF=1.958
  31. A.S. Poryvaev, D.M. Polyukhov, E. Gjuzi, F. Hoffmann, M. Froba, M.V. Fedin
    Radical-Doped Metal–Organic Framework: Route to Nanoscale Defects and Magnetostructural Functionalities
    Inorganic Chemistry 2019, 58, 13, 8471-8479 doi:10.1021/acs.inorgchem.9b00696, IF=4.849
  32. N.A. Muraleva, O.S. Kozhevnikova, A.Z. Fursova, N.G. Kolosova
    Suppression of AMD-Like Pathology by Mitochondria-Targeted Antioxidant SkQ1 Is Associated with a Decrease in the Accumulation of Amyloid β and in mTOR Activity
    Antioxidants 2019, 8(6), 177 doi:10.3390/antiox8060177, IF=4.52
  33. N.A. Muraleva, N.G. Kolosova, N.A. Stefanova
    p38 MAPK–dependent alphaB-crystallin phosphorylation in Alzheimer's disease-like pathology in OXYS rats
    Experimental Gerontology, Volume 119, May 2019, Pp 45-52 doi:10.1016/j.exger.2019.01.017, IF=3.08
  34. D. V. Telegina, N.G. Kolosova, O. S. Kozhevnikova
    Immunohistochemical localization of NGF, BDNF, and their receptors in a normal and AMD-like rat retina
    BMC Medical Genomics, March 2019, 12(Supp. 2):48 (From 11th International Multiconference “Bioinformatics of Genome Regulation and StructureSystems Biology” - BGRSSB-2018 Novosibirsk, Russia. 20-25 August 2018) doi:10.1186/s12920-019-0493-8, IF=2.568
  35. Д.В. Трухин, О.Ю. Рогожникова, Т.И. Троицкая, А.А. Кужелев, Е.В. Амосов, H.J. Halpern, В.В. Коваль, В.М. Тормышев
    Новые спиновые зонды: три-и гексакатионные производные стабильных радикалов трис(тетратиаарил)метильного ряда
    Журнал органической химии. 2019. Т. 55. № 3. С. 347-353. DOI:10.1134/S0514749219030030 (New Spin Probes: Triand Hexacationic Derivatives of Persistent Tris(tetrathioaryl)methyl Radicals/ D.V. Trukhin, O.Yu.Rogozhnikova, T.I. Troitskaya, A.A, Kuzhelev, E.V. Amosov,H.J. Halpernc, V.V. Koval'b, V.M. Tormyshev// Russian Journal of Organic Chemistry, 2019, V. 55, N 3, pp 296-301 doi:10.1134/S1070428019030035), IF=0.751
  36. M. Edeleva, G. Audran, S. Marque, E. Bagryanskaya
    Smart Control of Nitroxide-Mediated Polymerization Initiators’ Reactivity by pH, Complexation with Metals, and Chemical Transformations
    Materials, 2019, V. 12, N 5, Pp. 688-707 doi:10.3390/ma12050688, IF=2.972

Тезисы докладов на конференциях


    2020
  1. П.А. Федюшин, Е.В. Зайцева, Т.В. Рыбалова, Е.В. Третьяков
    Новый подход к синтезу трет-бутиларилнитроксилов
    Сборник тезисов Научной конференции «Марковниковские чтения. Органическая химия: от Марковникова до наших дней»,Школа-конференция молодых ученых «Органическая химия: традиции и современность», Пансионат МГУ Красновидово, 17-20 января 2019 года, стр.93

  2. 2019
  3. I.F. Zhurko, S.A. Dobrynin, Yu.I. Glazachev, D.A. Komarov, A.A. Bobko, I.A. Kirilyuk
    Cyclic nitroxides with tert-butyl group at α-carbon
    the 13th Japanese-Russian Workshop on “Open Shell Compounds and Molecular Spin Devices”, November 10-13, 2019, Awaji Island, Japan., 3PM10
  4. Yu.V. Khoroshunova, D.A. Morozov, A.I. Taratayko, Yu.I. Glazachev, I.A. Kirilyuk
    Conformationally rigid pyrrolidine nitroxides: synthesis and transformations
    the 13th Japanese-Russian Workshop on “Open Shell Compounds and Molecular Spin Devices”, November 10-13, 2019, Awaji Island, Japan., 2AM09
  5. D. Mazhukin, E. Zaytseva, Y. Ten, D. Shiomi, Y. Gatilov, A. Yu, K. Sugisaki, A. Bogomyakov, K. Sato, T. Takui, E. Bagryanskaya
    New trends in the chemistry of hybrid phenoxyl-nitroxides
    the 13th Japanese-Russian Workshop on “Open Shell Compounds and Molecular Spin Devices”, November 10-13, 2019, Awaji Island, Japan., 2AM06
  6. D.A. Morozov, S.A. Dobrynin, Yu.I. Glazachev, I.A. Kirilyuk
    2,2,5,5-Tetraethyl substituted pyrroline nitroxides: Synthesis and 3PM12 transformations
    the 13th Japanese-Russian Workshop on “Open Shell Compounds and Molecular Spin Devices”, November 10-13, 2019, Awaji Island, Japan., 3PM12
  7. V.M. Tormyshev, O.Yu. Rogozhnikova, D.V. Trukhin, T.I. Troitskaya, M.K. Bowman, E.G. Bagryanskaya
    Trityl Spin Labels in Distance Measurements in Biomolecules Using SDSL and Pulsed ESR
    XIth International Workshop on EPR in Biology and Medicine. Krakow, Poland, October 6-10, 2019, Book of Abstracts, p. 68
  8. K. Sato, R. Hirao, I. Timofeev, O. Krumkacheva, E. Zaytseva, O. Rogozhnikova, V. Tormyshev, D. Trukhin, E. Bagryanskay, T. Gutmann, V. Klimavicius, G. Buntkowsky, K. Sugisaki, S. Nakazawa, H. Matsuoka, K. Toyota, D. Shiomi, T. Takui
    Multi-Frequency EPR/ENDOR, DNP and AWG Pulse MW Spectroscopy of g-Engineered Trityl-Aryl-Nitroxide biradicals
    Int. Conference "Magnetic Resonance - Current State and Future Perspectives" and satellite XXI International Youth Scientific School "Actual problems of magnetic resonance and its application", September 23-27, 2019 Kazan, Russia, , Book of Abst. P. 173
  9. E. Zaytseva, I. Timofeev, O. Krumkacheva, D. Parkhomenko, D. Mazhukin, K. Sato, H. Matsuoka, T. Takui, E. Bagryanskaya
    EPR and DEER characterization of new mixed weakly coupled nitroxide triradicals for molecular three-spin qubits
    International conference ORGEL-2019, 23-29 Sept., Novosibirsk, Russia, Book of abst. PP-45, page 101
  10. K. Sato, R. Hirao, I. Timofeev, O. Krumkacheva, E.V. Zaitseva, V.M. Tormyshev, D.V. Trukhin, O.Yu. Rogozhnikova, D.A. Parkhomenko, E. Bagryanskaya, T. Gutmann, V. Klimavicius, G. Buntkowsky, K. Sugisaki, Sh. Nakazawa, H. Matsuoka, K. Toyota, D. Shiomi, T. Takui
    Trityl-Aryl-Niroxide Based Genuinely g-Engineered Biradicals, as Studied by DNP, Multi-Frequency ESR/ENDOR, AWG Pulse MW Spectroscopy and Quantum Chemical Calculations
    International conference ORGEL-2019, 23-29 Sept., Novosibirsk, Russia, Book of abst. PP-39, page 95
  11. D.l. Polyukhov, A. Poryvaev, M. Fedin
    Precise Measurements and of effective window sizes of ZIF-8 monitored by Electron Paramagnetic Resonance
    International conference ORGEL-2019, 23-29 Sept., Novosibirsk, Russia, Book of abst. PP-20, page 76
  12. E. Zaytseva, D. Shiomi, Yu. Ten, Yu. Gatilov, D. Stass, A. Bogomyakov, A. Yu, K. Sugisaki, K. Sato, T. Takui, E. Bagryanskaya, D. Mazhukin
    Magnetic properties of π-conjugated phenoxyl-nitroxide radicals as designed for advanced molecular magnetism
    International conference ORGEL-2019, 23-29 Sept., Novosibirsk, Russia, Book of abst. O-1, page 38
  13. M.K. Bowman
    Electron Spin Relaxation and Motion in Solids: Spin, Spatial, Spectral
    Int. Conference "Magnetic Resonance - Current State and Future Perspectives" and satellite XXI International Youth Scientific School "Actual problems of magnetic resonance and its application", September 23-27, 2019 Kazan, Russia, , Book of Abst. P. 22
  14. А.И. Таратайко, Е.В. Зайцева, С.А. Добрынин, И.А. Кирилюк
    Синтез профлуоресцентных нитроксильных радикалов – потенциальных зондов для биофизических исследований
    Сборник тезисов докладов V Междисциплинарной конференции «Молекулярные и Биологические аспекты Химии, Фармацевтики и Фармакологии», Судак, Крым, РФ, 15-18 сентября 2019 года, С. 233
  15. С.А. Добрынин, Е.В. Зайцева, И.А. Кирилюк
    Стереоэлектронные эффекты в нитроксильных радикалах пирролидинового ряда
    Сборник тезисов докладов V Междисциплинарной конференции «Молекулярные и Биологические аспекты Химии, Фармацевтики и Фармакологии», Судак, Крым, РФ, 15-18 сентября 2019 года, С. 146
  16. A.I. Taratayko, S.A. Dobrynin, E.V. Zaytseva, I.A. Kirilyuk
    2-Functionalized sterically shielded pyrrolidine nitroxides
    the 13th Japanese-Russian Workshop on “Open Shell Compounds and Molecular Spin Devices”, November 10-13, 2019, Awaji Island, Japan., 3PM11
  17. O.Yu. Rogozhnikova, D.V. Trukhin, T.I. Troitskaya, M.K. Bowman, E.G. Bagryanskaya, V.M. Tormyshev
    Persistent tris(tetrathiaaryl)methyl radicals - a new generation of spin labels designed for studying the structure of biopolymers
    XXI Mendeleev Congress on general and applied chemistry. Saint Petersburg 9-13 September, 2019.Book of abstracts. Volume 1, Section 1, Page 256
  18. P.A. Fedyushin, L.Yu. Gurskaya, E.V. Panteleeva, T.V. Rybalova, E.V. Zaytseva, E.V. Tretyakov
    Exploration of SN F -approach toward functionalized nitroxides and nitronyl nitroxides
    Book of abstracts of XI International Conference on Chemistry for Young Scientists. Saint Petersburg (September 9-13, 2019), P. 243
  19. S. Zhivetyeva, P.V. Petunin, P.S. Postnikov, I.Yu. Bagryanskaya, E.V. Zaytseva, E.G. Bagryanskaya, E.V. Tretyakov
    First exchange-coupled verdazyl-nitroxide diradical: synthesis, structure and magnetic properties
    Book of abstracts of XI International Conference on Chemistry for Young Scientists. Saint Petersburg (September 9-13, 2019), P. 154
  20. С.С. Овчеренко, А.В. Шернюков, О.А. Чинак, Е.Г. Багрянская
    Изучение свойств проникновения фрагмента к-казеина RL2 внутрь клеток человека
    В книге: Биотехнология - медицине будущего Материалы всероссийской мультиконференции с международным участием. Новосибирск, 2019. С. 199.
  21. С.С. Овчеренко, А.В. Шернюков, О.А. Чинак, Е.Г. Багрянская
    Изучение структурных и агрегационных свойств фрагмента K-казеина RL2
    В книге: Биотехнология - медицине будущего Материалы всероссийской мультиконференции с международным участием. Новосибирск, 2019. С. 198.
  22. I.O. Timofeev, A.S. Spitsina, N.Sh. Lebedeva, O.I. Koifman, A.S. Chubarov, M.V. Fedin, E.G. Bagraynskaya, O.A. Krumkacheva
    EPR studies of complexes of photosensitizers with albumin promising in photodynamic therapy of cancer
    В книге: Биотехнология - медицине будущего Материалы всероссийской мультиконференции с международным участием. Новосибирск, 2019. С. 139.
  23. С.С. Куцейкин
    Получение контрастных агентов для 1H магнитно-резонансной томографиина основе человеческого сывороточного альбумина инитроксильных радикалов
    В книге: Химия материалы 57-й Международной научной студенческой конференции. Новосибирск, 2019. С. 71.
  24. Ю.В. Хорошунова
    Синтез и модификации нитроксильных радикалов со спиро-2'-гидроксиметилциклопентановым фрагментом
    В книге: Химия материалы 57-й Международной научной студенческой конференции. Новосибирск, 2019. С. 60.
  25. E. Zaytseva, Yu. Ten, Yu. Gatilov, Ai. Yu, D. Mazhukin, E. Bagryanskaya
    Hybrid Phenoxyl-Nitroxide Radicals as a New Building Block in Magnetochemistry
    The 52nd Annual International Meeting of the ESR Spectroscopy Group of the Royal Society of Chemistry, April , 7- 11, 2019, Glasgow, UK, Book of Abst., P1.

Патенты

  1. С.А. Добрынин, Ю.В. Хорошунова, И.А. Кирилюк
    Способ получения 2,2,5,5-тетраэтил-3-карбоксипирролидин-1-оксила
    Заявка 2019119971, приоритет от 25.06.2019, Патент RU 2 702 331 , Бюл. № 28, опубликовано: 08.10.2019



 

Научные подразделения