Новосибирский институт органической химии им. Н.Н. Ворожцова принимает активное участие в подготовке молодых специалистов.
В Институте действует аспирантура, и ведущие учёные участвуют в подготовке научных кадров высшей квалификации для работы в НИИ и ВУЗах.
Ежегодно в аспирантуре НИОХ СО РАН обучаются более 20 аспирантов по программам подготовки научных и научно-педагогических кадров:
- в соответствии с ФГОС: направление подготовки 04.06.01 Химические науки (специальности 02.00.03 - органическая химия, 02.00.04 - физическая химия); направление подготовки 30.06.01 Фундаментальная медицина (специальность 14.03.06 - фармакология, клиническая фармакология),
- а также с 2022/23 учебного года в соответствии с ФГТ по научным специальностям:
- 1.4.2 Аналитическая химия
- 1.4.3 Органическая химия
- 1.4.4 Физическая химия
- 1.4.16 Медицинская химия
- 3.3.6 Фармакология, клиническая фармакология
Институт является базовым для кафедры органической химии факультета естественных наук Новосибирского государственного университета.
Кроме того, сотрудники Института читают лекции и проводят семинарские занятия на медицинском и физическом факультетах НГУ, в Новосибирском государственном педагогическом университете, Новосибирском Государственном техническом Университете, в Специализированном учебном научном центре НГУ, в Новосибирском химико-технологическом колледже им. Д. И. Менделеева.
Учёный совет НИОХ СО РАН ежегодно присуждает стипендии и премии им. Н.Н. Ворожцова лучшим студентам ФЕН НГУ по представлению кафедры органической химии. С целью привлечения внимания студентов младших курсов к современной органической химии НИОХ СО РАН совместно с НГУ организует ежегодную Олимпиаду по органической химии.
В НИОХ СО РАН действует диссертационный совет 24.1.192.01 по защите диссертаций на соискание учёной степени доктора наук, учёной степени кандидата наук по специальности 1.4.3. (02.00.03) Органическая химия (химические науки).