Лаборатория магнитного резонанса биомолекулярных систем (ЛМРБС)

Лаборатория Магнитного Резонанса Биомолекулярных Систем

Лаборатория

Наименование проекта: Многочастотный электронный парамагнитный резонанс (ЭПР) для биохимических исследований

№ договора :14.W03.31.0034

Наименование ВУЗа: Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Новосибирский институт органической химии им. Н.Н. Ворожцова Сибирского отделения Российской академии наук

Области научных исследований: Химия

Цель проекта: Целью проекта является развитие и применение передовых методов спектроскопии электронного парамагнитного резонанса (ЭПР) к актуальным задачам в области биохимии и биомедицины, имеющие принципиальную значимость для развития методов диагностики и разработки стратегий лечения ряда социально важных заболеваний, таких как болезни сердечно-сосудистой системы, болезнь Альцгеймера, онкологические заболевания и др.

Задача проекта: Основной задачей данного проекта является создание высокотехнологичной ЭПР лаборатории мирового уровня, имеющей в своем распоряжении самый современный приборный парк с максимальной функциональностью, и укомплектованной высококвалифицированными кадрами.

Майкл Кейт Боуман

Основные сведения

Майкл Кейт Боуман

Гражданство: США

Ученые степень и звание: Кандидат химических наук, Профессор

Занимаемая должность: Профессор химии

Области научных интересов: Электронный парамагнитный резонанс, спиновая релаксация, биофизика, перенос электрона

Научные достижения

Научные достижения:

Профессор Боуман является лидером в разработке и применении импульсных методов в ЭПР спектроскопии для следующего круга задач: структурная и функциональная характеристика реакционноспособных химических соединений, интермедиатов, биомолекулярных систем, определение расстояний и геометрических параметров в биомолекулах и биологических системах, измерение переноса энергии, релаксация и реакционная способность.
1975 - Определение структуры комплекса электрона и молекулярного стекла,
1978 - Первые исследования хлорофилла и фотосинтетических систем методом спинового эха,
1979 - Первые исследования нитроксильных радикалов в жидкостях при комнатной температуре методом спинового эха,
1980 - Разработка первого импульсного ЭПР спектрометра,
1982 - Установил, что перенос электрона происходит из возбужденного синглетного состояния при фотосинтезе в бактериях,
1986 - Первые исследования спин-меченных белков при физиологических концентрациях и температурах методом спин-электронного эха,
1988 - In Vivo ЭПР измерения на живом сердце крысы,
1988 - ЭПР-измерения с Фурье преобразованием кинетики электронного переноса в жидкости,
1990 - Изучение дефекта внедрения атома никеля в кристалл алмаза,
1995 - Разработка модели ширины линии и аналитических методов для HYSCORE спектроскопии в неориентированных твердых телах,
1996 - Описание белков, содержащих железо, методом HYSCORE и импульсного ЭПР,
2002 - Определение механизма ингибирования цитохрома b6f металлами,
2004 - Описание нового гема Х в цитохроме b6f,
2005 - Определение структуры тритильных радикалов в растворе,
2007 - Разработан метод описания структуры семихинонового интермедиата в цитохроме bc1 методом ЭПР,
2010 - Измерено изменение структуры каталитической РНК в присутствии ионов металлов,
2012 - Обнаружен новый метод присоединения для ингибиторов II типа белков P450,
2013 - Разработан новый импульсный метод для оксиметрических ЭПР измерений,
2013 - Определена локализация интермедиатов энзимов в цитохроме bc1 и NO-синтазы методом ЭПР-релаксации,
2015 - Охарактеризовал свойства самоструктурирующихся агрегатов тритильных радикалов методом динамической поляризации ядер,
2016 - Охарактеризовал электронную спиновую динамику триарилметильных радикалов в процессах динамической ядерной поляризации,
2016 - Открыл новый биомаркер для разобщающейся NO синтазы

Награды

Награды:

1988 - награда R&D-100 Award за ЭПР-измерения с Фурье преобразованием кинетики электронного переноса в жидкости,
2003 - серебряная медаль по химии за вклад в области ЭПР в химии,
2016 - международная премия имени Завойского за достижения в области магнитного резонанса за выдающиеся приложения электронного парамагнитного резонанса во всех областях науки.

Основные публикации

Основные публикации:

Bowman MK, Chen H, Maryasov AG. Fourier-Transform EPR. In: Goldfarb D, Stoll S, editors. Emagres. 6. 15 SEP 2017 ed. Chichester: John Wiley & Sons, Ltd; 2017. p. 387-406.
Lockart MM, Rodriguez CA, Atkins WM, Bowman MK. CW EPR parameters reveal cytochrome P450 ligand binding modes. J Inorg Biochem. 2018;183:157-64.
Chen H, Maryasov AG, Rogozhnikova OY, Trukhin DV, Tormyshev VM, Bowman MK. Electron spin dynamics and spin-lattice relaxation of trityl radicals in frozen solutions. PCCP. 2016;18(36):24954-65.
Trukhin DV, Rogozhnikova OY, Troitskaya TI, Vasiliev VG, Bowman MK, Tormyshev VM. Facile and High-Yielding Synthesis of TAM Biradicals and Monofunctional TAM Radicals. Synlett. 2016;27(6):893-9.
Krzyaniak MD, Cruce AA, Vennam P, Lockart M, Berka V, Tsai AL, et al. The tetrahydrobiopterin radical interacting with high- and low-spin heme in neuronal nitric oxide synthase - A new indicator of the extent of NOS coupling. Free Radic Biol Med. 2016;101:367-77.
Conner KP, Schimpf AM, Cruce AA, McLean KJ, Munro AW, Frank DJ, et al. Strength of Axial Water Ligation in Substrate-Free Cytochrome P450s Is Isoform Dependent. Biochemistry. 2014;53(9):1428-34.
Epel B, Bowman MK, Mailer C, Halpern HJ. Absolute Oxygen R-1e Imaging In Vivo with Pulse Electron Paramagnetic Resonance. Magn Reson Med. 2014;72(2):362-8.
Trukhan SN, Yudanov VF, Tormyshev VM, Rogozhnikova OY, Trukhin DV, Bowman MK, et al. Hyperfine interactions of narrow-line trityl radical with solvent molecules. J Magn Reson. 2013;233:29-36.
Vennam PR, Fisher N, Krzyaniak MD, Kramer DM, Bowman MK. A Caged, Destabilized, Free Radical Intermediate in the Q-Cycle. ChemBioChem. 2013;14(14):1745-53.
Conner KP, Vennam P, Woods CM, Krzyaniak MD, Bowman MK, Atkins WM. 1,2,3-Triazole-Heme Interactions in Cytochrome P450: Functionally Competent Triazole-Water-Heme Complexes. Biochemistry. 2012;51(32):6441-57.
Kim NK, Bowman MK, DeRose VJ. Precise mapping of RNA tertiary structure via nanometer distance measurements with double electron-electron resonance spectroscopy. J Am Chem Soc. 2010;132(26):8882-4.
Cape JL, Bowman MK, Kramer DM. A semiquinone intermediate generated at the Qo site of the cytochrome bc1 complex: importance for the Q-cycle and superoxide production. P Natl Acad Sci USA. 2007;104(19):7887-92.
Cape JL, Bowman MK, Kramer DM. Understanding the cytochrome bc complexes by what they don't do. The Q-cycle at 30. Trends Plant Sci. 2006;11(1):46-55.
Bowman MK, Mailer C, Halpern HJ. The solution conformation of triarylmethyl radicals. J Magn Reson. 2005;172(2):254-67.
Halpern HJ, Jaffe DR, Nguyen TD, Haraf DJ, Spencer DP, Bowman MK, et al. Measurement of bioreduction rates of cells with distinct responses to ionizing radiation and cisplatin. Biochim Biophys Acta. 1991;1093 (2-3):121-4.
Isoya J, Kanda H, Norris JR, Tang J, Bowman MK. Fourier-transform and continuous-wave EPR studies of nickel in synthetic diamond: Site and spin multiplicity. Phys Rev B Condens Matter. 1990;41(7):3905-13.

СОТРУДНИКИ

Сотрудники

№	Сотрудник	Должность	Кабинет	Телефон	Телефон вн.	email	Публикации
№	Сотрудник	Должность	Кабинет	Телефон	Телефон вн.	email	по годам	по виду	по If
Нет сотрудников

ПУБЛИКАЦИИ 2018 г.

Список статей по мегагранту за 2018 год:

1) Novel Biradicals for Direct Excitation Highfield Dynamic Nuclear Polarization
S. Bothe, J. Nowag, V. Klimavicius, M.M. Hoffmann, T.I. Troitskaya, E.V. Amosov, V.M. Tormyshev, I. Kirilyuk, A. Taratayko, A.A. Kuzhelev, D. Parkhomenko, E.G. Bagryanskaya, T. Gutmann, G. Buntkowsky.// J. Phys. Chem. C 2018, 122 (21), 11422-11432, DOI:10.1021/acs.jpcc.8b02570, IF=4.484 / Q1

Альметрики:

2) In vivo extracellular pH mapping of tumours using electron paramagnetic resonance, Denis A. Komarov, Yuki Ichikawa, Kumiko Yamamoto, Neil J. Stewart, Shingo Matsumoto, Hironobu Yasui, Igor A. Kirilyuk, Valery V. Khramtsov, Osamu Inanamib and Hiroshi Hirata, Anal. Chem., 2018, 90 (23), pp 13938–13945 doi: 10.1021/acs.analchem.8b03328 IF= 6.042 / Q1

Альметрики:

3) Aradical containing injectable in-situ-oleogelandemulgelforprolongedin-vivooxygen measurements with CW EPR, Lisa Lampp, Olga Yu. Rogozhnikova, Dmitry V. Trukhin, Victor M. Tormyshev, Michael K. Bowman, Nllathamby Devasahayam, Murali C. Krishna, Karsten Mäder, Peter Imming, Free Radical Biology and Medicine, 2018 , DOI: 10.1016/j.freeradbiomed.2018.10.442, IF=6.02 / Q1

4) Electron-Spin Relaxation of Triarylmethyl Radicals in Glassy Trehalose A.A. Kuzhelev, O.A. Krumkacheva, I.O. Timofeev, V.M. Tormyshev, M.V. Fedin, E.G. Bagryanskaya, Applied Magnetic Resonance, 2018, 49 (11), pp 1171-1180 doi:10.1007/s00723-018-1023-0, IF=0.835 / Q4

5) Radical Polymerization of Radical-Labeled Monomers: The Triarylmethyl-Based Radical Monomer as an Example, Mariya V. Edeleva, Sylvain R. A. Marque, Olga Yu. Rogozhnikova, Victor M. Tormyshev, Tatiana I. Troitskaya, Elena G. Bagryanskaya, Journal of polymer science Part A: Polymer chemistry 2018, 56 (23), pp.2656-2664) DOI: 10.1002/pola.29249, IF=2.588 / Q2

6) Changes in Retinal Glial Cells with Age and during Development of Age Related Macular Degeneration, D.V. Telegina, O.S. Kozhevnikova, N.G. Kolosova, Biochemistry (Moscow), 2018, 83, (9), pp. 1009-1017, DOI: 10.1134/S000629791809002X, IF=1.724 / Q4

7) Pulse EPR of Triarylmethyl Probes: New Approach for Investigation of Molecular Motions in Soft Matter, Andrey A. Kuzhelev, Olesya A. Krumkacheva, Mikhail Yu. Ivanov, Sergey A. Prikhod’ko, Nicolay Yu. Adonin, Victor M. Tormyshev, Michael K. Bowman, Matvey V. Fedin, Elena G. Bagryanskaya, J. Phys. Chem. B 2018, 122 (36), 8624−8630, DOI: 10.1021/acs.jpcb.8b07714, IF=3.146 / Q2

8) Oxygen-induced leakage of spin polarization in Overhauser-enhanced magnetic resonance imaging: application for oximetry in tumors, A.A. Gorodetskii, T.D. Eubank, B. Driesschaert, M. Poncelet, E. Ellis, V.V. Khramtsov, A.A. Bobko, Journal of Magnetic Resonance, 2018, 297:42-50. doi: 10.1016/j.jmr.2018.10.005, IF=2.586 / Q2

9) Alterations of hippocampal neurogenesis during development of Alzheimer's disease-like pathology in OXYS rats, Ekaterina A. Rudnitskaya, Tatiana A. Kozlova, Alena O.Burnyasheva, Natalyia G. Kolosova, Natalia A. Stefanova, Experimental Gerontology 115 (2019) 32-45 doi: 10.1016/j.exger.2018.11.008, IF= 3.224 / Q2

10) Synthesis of paramagnetic spiropyran derivatives, Andrey I. Taratayko, Tatyana V. Rybalova, Vladimir A. Reznikov, Chemistry of Heterocyclic Compounds 2018, 54(10), 981-983, DOI: 10.1007/s10593-018-2375-y, IF= 1.201 / Q3

11) Versatile approach to activation of alkoxyamine homolysis by 1,3-dipolar cycloaddition for efficient and safe nitroxide mediated polymerization, Mariya Edeleva, Denis Morozov, Dmitriy Parkhomenko, Yulia Polienko, Anna Iurchenkova, Igor Kirilyik, Elena Bagryanskaya, Chem. Commun., 2019, 55, 190-193, DOI: 10.1039/C8CC08541B IF=6.29 / Q1

12) The human ribosome can interact with the abasic site in mRNA via a specific peptide of the uS3 protein located near the mRNA entry channel , Anastasia S. Ochkasova, Maria I. Meschaninova, Aliya G. Venyaminova, Anton V. Ivanov, Dmitri M. Graifer, Galina G. Karpova, Biochimie 2019, 158, 117-125, DOI:10.1016/j.biochi.2018.12.015, IF=/ Q2

ПУБЛИКАЦИИ

Публикации сотрудников подразделения (БД НИОХ СО РАН) 1 (2018 - 2024 )

Монографии, главы в научных книгах, учебные пособия

2020

P. Kaletina, M. Edeleva
Chapter 3 - Fluorinated initiators, mediators, and solvents in controlled radical polymerization
Opportunities for Fluoropolymers, Synthesis, Characterization, Processing, Simulation and Recycling, Progress in Fluorine Science, 2020, Pages 69-88 doi:10.1016/B978-0-12-821966-9.00003-1

Обзоры, статьи в научных журналах

2022

A.G. Maryasov, M.K. Bowman
Anisotropic g-Tensor and Abragam’s Dipole Alphabet: New Words
Applied Magnetic Resonance (2022), first published 23 November 2022 doi:10.1007/s00723-022-01512-9, IF=0.974

2021

M. l Froba, E. Gjuzi, F. Hoffmann, A.S. Poryvaev, M.V. Fedin, D.M. Polyukhov
Blatter Radical-Grafted Mesoporous Silica as Prospective Nanoplatform for Spin Manipulation at Ambient Conditions
Angewandte Chemie International Edition, First published: 24 January 2021 doi:10.1002/anie.202015058, IF=12.256
Yu.V. Khoroshunova,D. A. Morozov,A. I. Taratayko,S. A. Dobrynin,I. V. Eltsov,T. V. Rybalova,Yu. S. Sotnikova,D. N. Polovyanenko,N. B. Asanbaeva,I. A. Kirilyuk
The Reactions of 6-(Hydroxymethyl)-2,2-dimethyl-1-azaspiro[4.4]nonanes with Methanesulfonyl Chloride or PPh3-CBr4
Molecules 2021, 26(19), 6000 doi:10.3390/molecules26196000, IF=4.411
A.G. Matveeva, V.N. Syryamina, V.M. Nekrasov, M.K. Bowman
Non-uniform sampling in pulse dipolar spectroscopy by EPR: the redistribution of noise and the optimization of data acquisition
Physical Chemistry Chemical Physics, 2021, V.,23, N 17, Pp 10335-10346 doi:10.1039/d1cp00705j, IF=3.676
A. Chubarov, A. Spitsyna, O. Krumkacheva, D. Mitin, D. Suvorov, V. Tormyshev, M. Fedin, M.K. Bowman, E. Bagryanskaya
Reversible Dimerization of Human Serum Albumin
Molecules 2021, 26(1), 108 doi:10.3390/molecules26010108, IF=4.411

2020

Д.В. Телегина, О.С. Кожевникова, А.Ж. Фурсова, Н.Г. Колосова
Аутофагия как мишень ретинопротекторного действия митохондриального антиоксиданта SkQ1
Биохимия. 2020. Т. 85. № 12. С. 1928-1938. DOI: 10.31857/S0320972520120155 (Autophagy as a Target for the Retinoprotective Effects of the Mitochondria-Targeted Antioxidant SkQ1/ D.V. Telegina, O.S. Kozhevnikova, A.Zh. Fursova, N.G. Kolosova// Biochemistry (Moscow), 2020, V. 85, N 12-13, Pp.1640-1649 doi:10.1134/S0006297920120159), IF=1.978
M. Yu. Ivanov, A. S. Poryvaev, D. M. Polyukhov, S. A. Prikhod'ko, N.Yu. Adonin, M. V. Fedin
Nanoconfinement effects on structural anomalies in imidazolium ionic liquids
Nanoscale, 2020,12 (46), 23480-23487 doi:10.1039/D0NR06961B, IF=6.894
T.V. Popova, O.A. Krumkacheva, A.S. Burmakova, A.S. Spitsyna, O.D. Zakharova, V.Al. Lisitskiy, I.A. Kirilyuk, V.N. Silnikov, M. Bowman, E. Bagryanskaya, T. Godovikova
Protein modification by thiolactone homocysteine chemistry: a multifunctionalized human serum albumin theranostic
RSC Med. Chem., 2020,11, 1314-1325 doi:10.1039/C9MD00516A
A. G. Maryasov, M. K. Bowman
Anisotropic S=1/2 Kramers Doublets: g-Matrix, the Tensor G, and Dynamics of the Spin and Magnetic Moment
Applied Magnetic Resonance (2020), V. 51, N 9-10, Pp 1201-1210 doi:10.1007/s00723-020-01257-3, IF=0.824
N. A. Muraleva ,N. A. Stefanova,N. G. Kolosova
SkQ1 Suppresses the p38 MAPK Signaling Pathway Involved in Alzheimer's Disease-Like Pathology in OXYS Rats
Antioxidants 2020, 9(8), 676 doi:10.3390/antiox9080676, IF=5.13
E.A. Kulikova, O.S. Kozhevnikova, A.V. Kulikov, N.G. Kolosova, T.M. Khomenko, K.P. Volcho, N.F. Salakhutdinov, D.V. Telegina
Alterations of STEP46 and STEP61 Expression in the Rat Retina with Age and AMD-Like Retinopathy Development
Int. J. Mol. Sci. 2020, 21(15), 5182 doi:10.3390/ijms21155182, IF=4.556
A.G. Maryasov, M.K. Bowman
Comment on "Modeling of motional EPR spectra using hindered Brownian rotational diffusion and the stochastic Liouville equation" [J. Chem. Phys. 152, 094103 (2020)]
Journal of Chemical Physics, 2020, V. 153, N 2, Art.num. 027101 DOI: doi:10.1063/5.0010661, IF=2.99
D.M. Polyukhov, S. Krause, V. Bon, A.S. Poryvaev, S. Kaskel, M.V. Fedin
Structural Transitions of the Metal-Organic Framework DUT-49(Cu) upon Physi- and Chemisorption Studied by in Situ Electron Paramagnetic Resonance Spectroscopy
J. Phys. Chem. Lett. 2020, 11, 15, 5856-5862 doi:10.1021/acs.jpclett.0c01705, IF=6.71
N. Sannikova, I. Timofeev, E. Bagryanskaya, M. Bowman, M. Fedin, O. Krumkacheva
Electron Spin Relaxation of Photoexcited Porphyrin in Water-Glycerol Glass
Molecules 2020, 25(11), 2677 doi:10.3390/molecules25112677, IF=3.267
E.G. Kovaleva, L.S. Molochnikov, D. Tambasova, A. Marek, M. Chestnut, V.A. Osipova, D.O. Antonov, I.A. Kirilyuk, A. Smirnov
Electrostatic Properties of Inner Nanopore Surfaces of Anodic Aluminum Oxide Membranes upon High Temperature Annealing Revealed by EPR of pH-sensitive Spin Probes and Labels
Journal of Membrane Science, V. 604, 1 June 2020, 118084 doi:10.1016/j.memsci.2020.118084, IF=7.183
A.S. Poryvaev, D.M. Polyukhov, M.V. Fedin
Mitigation of Pressure-Induced Amorphization in Metal–Organic Framework ZIF-8 upon EPR Control
ACS Appl. Mater. Interfaces 2020, V. 12, N 14, Pp 16655-16661 doi:10.1021/acsami.0c03462, IF=8.758
S. Dobrynin, S. Kutseikin, D. Morozov, O. Krumkacheva, A. Spitsyna, Yu. Gatilov, V. Silnikov, G. Angelovski, M.K. Bowman, I. Kirilyuk, A. Chubarov
Human Serum Albumin Labelled with Sterically-Hindered Nitroxides as Potential MRI Contrast Agents
Molecules 2020, 25(7), 1709 doi:10.3390/molecules25071709, IF=3.267
E. Zaytseva, D. Shiomi, Yu. Ten, Yu.V. Gatilov, A. Lomanovich, D.V. Stass, A.S. Bogomyakov, A. Yu, K. Sugisaki, K. Sato, T. Takui, E.G. Bagryanskaya, D. Mazhukin
Magnetic Properties of π-Conjugated Hybrid Phenoxyl-Nitroxide Radicals with Extended π-Spin Delocalization
The Journal of Physical Chemistry A, 2020, 124, 12, 2416-2426 doi:10.1021/acs.jpca.9b11856, IF=2.6
V. Tormyshev, A. Chubarov, O. Krumkacheva, D. Trukhin, O. Rogozhnikova, A. Spitsyna, A. Kuzhelev, V. Koval, M. Fedin, T. Godovikova, M. Bowman, E.G. Bagryanskaya
Methanethiosulfonate Derivative of OX063 Trityl: a Promising and Efficient Reagent for SDSL of Proteins
Chemistry-A European Journal, 2020, V.26, N 12, Pp 2705-2712 doi:10.1002/chem.201904587, IF=4.857
I.F. Zhurko, S. Dobrynin, A.A. Gorodetskii, Yu.I. Glazachev, T.V. Rybalova, E.I. Chernyak, N. Asanbaeva, E.G. Bagryanskaya, I.A. Kirilyuk
2-Butyl-2-tert-butyl-5,5-diethylpyrrolidine-1-oxyls: Synthesis and Properties
Molecules 2020, 25(4), 845 doi:10.3390/molecules25040845, IF=3.267
A.A. Kuzhelev, V.M. Tormyshev, V.F. Plyusnin, O.Yu. Rogozhnikova, M.V. Edeleva, S.L. Veber, E.G. Bagryanskaya
Photochemistry of tris(2,3,5,6-tetrathiaaryl)methyl radicals in various solutions
Phys. Chem. Chem. Phys., 2020, V. 22, N 3, Pp 1019-1026 doi:10.1039/C9CP06213K, IF=3.43

2019

O.A. Krumkacheva, G.Yu. Shevelev, A.A. Lomzov, N.S. Dyrkheeva, A.A. Kuzhelev, V.V. Koval, V.M. Tormyshev, Yu.F. Polienko, M.V. Fedin, D.V. Pyshnyi, O.I. Lavrik, E.G. Bagryanskaya
DNA complexes with human apurinic/apyrimidinic endonuclease 1: structural insights revealed by pulsed dipolar EPR with orthogonal spin labeling
Nucleic Acids Research,2019, V. 47, N 15, Pp 7767-7780 doi:10.1093/nar/gkz620, IF=11.147
S.V. Nikitin, J. Sanchez-Marquez, I.I. Oleynik, I. Oleynik, E.G. Bagryanskaya
A screening DFT study of the para-substituent effect on local hyper-softness in bis(phenoxy-imine) titanium complexes to get insights about their catalytic activity in ethylene polymerization
Molecular Catalysis, 2019, V. 469, Pp 57-67 doi:10.1016/j.mcat.2019.02.024, IF=2.938
A.G. Maryasov, M.K. Bowman, M.V. Fedin, S.L. Veber
Theoretical Basis for Switching a Kramers Single Molecular Magnet by Circularly-Polarized Radiation
Materials 2019, 12(23), 3865 doi:10.3390/ma12233865, IF=2.971
A.A. Malygin, O.A. Krumkacheva, D.M. Graifer, I.O. Timofeev, A.S. Ochkasova, M.I. Meschaninova, A.G. Venyaminova, M.V. Fedin, M. Bowman, G.G. Karpova, E.G. Bagryanskaya
Exploring the interactions of short RNAs with the human 40S ribosomal subunit near the mRNA entry site by EPR spectroscopy
Nucleic Acids Research, 2019, V. 47, N 22, Pp 11850-11860 doi:10.1093/nar/gkz1039, IF=11.147
A.A. Gorodetskii, T.D. Eubank, B. Driesschaert, M. Poncelet, E. Ellis, V.V. Khramtsov, A.A. Bobko
Development of multifunctional Overhauser-enhanced magnetic resonance imaging for concurrent in vivo mapping of tumor interstitial oxygenation, acidosis and inorganic phosphate concentration
Scientific Reports, 2019, V. 9, Issue 1, Art.number 12093 doi:10.1038/s41598-019-48524-3, IF=4.11
S.A. Dobrynin, I.A. Kirilyuk, Yu.V. Gatilov, A.A. Kuzhelev, O.A. Krumkacheva, M.V. Fedin, M.K. Bowman, E.G. Bagryanskaya
Unexpected one-pot formation of the 1H-6a,8a-epiminotri-cyclopenta[a,c,e][8]annulene system from cyclopentanone, ammonia and dimethyl fumarate. Synthesis of highly strained polycyclic nitroxide and EPR study
Beilstein Journal of Organic Chemistry, 2019, V. 15, Pp 2664-2670 doi:10.3762/bjoc.15.259, IF=2.595
O.A. Krumkacheva, I.O. Timofeev, L.V. Politanskaya, Yu.F. Polienko, E.V. Tretyakov, O.Yu. Rogozhnikova, D.V. Trukhin, V.M. Tormyshev, A.S. Chubarov, E.G. Bagryanskaya, M.V. Fedin
Triplet Fullerenes as Prospective Spin Labels for Nanoscale Distance Measurements by Pulsed Dipolar EPR
Angewandte Chemie International Edition, 2019, V. 58, N 38, Pp 13271-13275 doi:10.1002/anie.201904152, IF=12.256
M.Y. Myshkin, R. Mannikko, O.A. Krumkacheva, D.S. Kulbatskii, A.O. Chugunov, A.A. Berkut, A.S. Paramonov, M.A. Shulepko, M.V. Fedin, M.G. Hanna, D.M. Kullmann, E.G. Bagryanskaya, A.S. Arseniev, M.P. Kirpichnikov, E.N. Lyukmanova, A.A. Vassilevski, Z.O. Shenkarev
Cell-free expression of sodium channel domains for pharmacology studies. noncanonical spider toxin binding site in the second voltage-sensing domain of human nav1.4 channel
Front. Pharmacol., 2019, V. 10, Art. number 953 doi:10.3389/fphar.2019.00953, IF=3.845
E. Babaylova, A. Malygin, A. Gopanenko, D. Graifer, G. Karpova
Tetrapeptide 60-63 of human ribosomal protein uS3 is crucial for translation initiation
Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Gene Regulatory Mechanisms, 2019, V. 1862, N 9, 194411 doi:10.1016/j.bbagrm.2019.194411, IF=4.598
Yu.V. Khoroshunova, D.A. Morozov, A.I. Taratayko, P.D. Gladkikh, Yu.I. Glazachev, I.A. Kirilyuk
Synthesis of 1-azaspiro[4.4]nonan-1-oxyls via intramolecular 1,3-dipolar cycloaddition
Beilstein Journal of Organic Chemistry, 2019, V. 15, Pp 2036-2042 doi:10.3762/bjoc.15.200, IF=2.595
D. Polyukhov, A.S. Poryvaev, S.A. Gromilov, M.V. Fedin
Precise Measurement and Controlled Tuning of Effective Window Sizes in ZIF-8 Framework for Efficient Separation of Xylenes
Nano Letters, 2019, V. 19, N 9, Pp 6506-6510 doi:10.1021/acs.nanolett.9b02730, IF=12.279
G. Audran, E. Bagryanskaya, I. Bagryanskaya, M. Edeleva, J.-P. Joly, S-R.A. Marque, A. Iurchenkova, P. Kaletina, S. Cherkasov, T.To. Hai, E. Tretyakov, S. Zhivetyeva
How intramolecular coordination bonding (ICB) controls the homolysis of the C-ON bond in alkoxyamines
RSC Adv., 2019,V. 9, N 44, Pp 25776-25789 doi:10.1039/C9RA05334D, IF=3.049
O.A. Chinak, A.V. Shernyukov, S.S. Ovcherenko, E.A. Sviridov, V.M. Golyshev, A.S. Fomin, I.A. Pyshnaya, E.V. Kuligina, V.A. Richter, E.G. Bagryanskaya
Structural and Aggregation Features of a Human k-Casein Fragment with Antitumor and Cell-Penetrating Properties
Molecules 2019, 24(16), 2919 doi:10.3390/molecules24162919, IF=3.59
T. Yokoyama, A. Taguchi, H. Kubota, N.J. Stewart, Sh. Matsumoto, I.A. Kirilyuk, H. Hirata
Simultaneous T2* mapping of 14N- and 15N-labeled dicarboxy-PROXYLs using CW-EPR-based single-point imaging
Journal of Magnetic Resonance, 2019, V. 305, Pp 122-130 doi:10.1016/j.jmr.2019.06.012, IF=2.689
E. Zaytseva, I. Timofeev, O. Krumkacheva, D. Parkhomenko, D. Mazhukin, K. Sato, H. Matsuoka, T. Takui, E. Bagryanskaya
EPR and DEER Characterization of New Mixed Weakly Coupled Nitroxide Triradicals for Molecular Three-Spin Qubits
Applied Magnetic Resonance, 2019, V. 50, N 8, pp 967-976 doi:10.1007/s00723-019-01125-9, IF=0.78
A. Ochkasova, M. Meschaninova, A. Venyaminova, A. Ivanov, D. Graifer, G. Karpova
The human ribosome as a possible mRNA quality controller that recognizes the abasic site by protein uS3
FEBS OPEN BIO, V. 9, Pp 163-163, Suppl. 1 Аннотация к встрече: P-11-010, WOS:000486972402108, IF=1.958
A.S. Poryvaev, D.M. Polyukhov, E. Gjuzi, F. Hoffmann, M. Froba, M.V. Fedin
Radical-Doped Metal–Organic Framework: Route to Nanoscale Defects and Magnetostructural Functionalities
Inorganic Chemistry 2019, 58, 13, 8471-8479 doi:10.1021/acs.inorgchem.9b00696, IF=4.849
N.A. Muraleva, O.S. Kozhevnikova, A.Z. Fursova, N.G. Kolosova
Suppression of AMD-Like Pathology by Mitochondria-Targeted Antioxidant SkQ1 Is Associated with a Decrease in the Accumulation of Amyloid β and in mTOR Activity
Antioxidants 2019, 8(6), 177 doi:10.3390/antiox8060177, IF=4.52
N.A. Muraleva, N.G. Kolosova, N.A. Stefanova
p38 MAPK–dependent alphaB-crystallin phosphorylation in Alzheimer's disease-like pathology in OXYS rats
Experimental Gerontology, Volume 119, May 2019, Pp 45-52 doi:10.1016/j.exger.2019.01.017, IF=3.08
D. V. Telegina, N.G. Kolosova, O. S. Kozhevnikova
Immunohistochemical localization of NGF, BDNF, and their receptors in a normal and AMD-like rat retina
BMC Medical Genomics, March 2019, 12(Supp. 2):48 (From 11th International Multiconference “Bioinformatics of Genome Regulation and StructureSystems Biology” - BGRSSB-2018 Novosibirsk, Russia. 20-25 August 2018) doi:10.1186/s12920-019-0493-8, IF=2.568
Д.В. Трухин, О.Ю. Рогожникова, Т.И. Троицкая, А.А. Кужелев, Е.В. Амосов, H.J. Halpern, В.В. Коваль, В.М. Тормышев
Новые спиновые зонды: три-и гексакатионные производные стабильных радикалов трис(тетратиаарил)метильного ряда
Журнал органической химии. 2019. Т. 55. № 3. С. 347-353. DOI:10.1134/S0514749219030030 (New Spin Probes: Triand Hexacationic Derivatives of Persistent Tris(tetrathioaryl)methyl Radicals/ D.V. Trukhin, O.Yu.Rogozhnikova, T.I. Troitskaya, A.A, Kuzhelev, E.V. Amosov,H.J. Halpernc, V.V. Koval'b, V.M. Tormyshev// Russian Journal of Organic Chemistry, 2019, V. 55, N 3, pp 296-301 doi:10.1134/S1070428019030035), IF=0.751
M. Edeleva, G. Audran, S. Marque, E. Bagryanskaya
Smart Control of Nitroxide-Mediated Polymerization Initiators’ Reactivity by pH, Complexation with Metals, and Chemical Transformations
Materials, 2019, V. 12, N 5, Pp. 688-707 doi:10.3390/ma12050688, IF=2.972

Тезисы докладов на конференциях

2022

A.G. Maryasov, M.K. Bowman
Bloch-Siegert effect in anisotropic paramagnetic centers with effective spin of 1/2
MODERN DEVELOPMENT OF MAGNETIC RESONANCE. ABSTRACTS OF THE INTERNATIONAL CONFERENCE AND WORKSHOP "SENSING AND QUANTUM INFORMATION IN FLUORISCENT NANOMATERIALS". KAZAN, October 3-7, 2022. P.16. http://kfti.knc.ru/mdmr/2022/book-of-abstracts.php
M.K. Bowman, A.G. Maryasov
Strange forms of magnetic dipole interactions for anisotropic spins
MODERN DEVELOPMENT OF MAGNETIC RESONANCE. ABSTRACTS OF THE INTERNATIONAL CONFERENCE AND WORKSHOP "SENSING AND QUANTUM INFORMATION IN FLUORISCENT NANOMATERIALS". KAZAN, October 3-7, 2022. P.8. http://kfti.knc.ru/mdmr/2022/book-of-abstracts.php

2021

A.G. Maryasov, M.K. Bowman
Static and Dynamic Vector Models in EPR of Anisotropic Centers
Международная конференция «Modern Development of Magnetic Resonance», MDMR 2021, Kazan, Russian Federation, 1-5 November 2021, Abstracts Book, p.128.
A.G. Maryasov, M.K. Bowman
Static and Dynamic Vector Models in EPR of Anisotropic Centers
Международная конференция «Modern Development of Magnetic Resonance», MDMR 2021, Kazan, Russian Federation, 1-5 November 2021, Abstracts Book, p.128.

2020

N. Sannikova , I. Timofeev, E. Bagryanskaya , M. Bowman , M. Fedin, O. Krumkacheva
Electron Spin Relaxation of Photoexcited Porphyrin in Water-Glycerol Glass
Aabstracts of the international conference and workshop "Diamond-based quantum systems for sensing and quantum information", Kazan, September 28-Ooctober 2, 2020, P. 195
П.А. Федюшин, Е.В. Зайцева, Т.В. Рыбалова, Е.В. Третьяков
Новый подход к синтезу трет-бутиларилнитроксилов
Сборник тезисов Научной конференции «Марковниковские чтения. Органическая химия: от Марковникова до наших дней»,Школа-конференция молодых ученых «Органическая химия: традиции и современность», Пансионат МГУ Красновидово, 17-20 января 2019 года, стр.93

2019

I.F. Zhurko, S.A. Dobrynin, Yu.I. Glazachev, D.A. Komarov, A.A. Bobko, I.A. Kirilyuk
Cyclic nitroxides with tert-butyl group at α-carbon
the 13th Japanese-Russian Workshop on “Open Shell Compounds and Molecular Spin Devices”, November 10-13, 2019, Awaji Island, Japan., 3PM10
Yu.V. Khoroshunova, D.A. Morozov, A.I. Taratayko, Yu.I. Glazachev, I.A. Kirilyuk
Conformationally rigid pyrrolidine nitroxides: synthesis and transformations
the 13th Japanese-Russian Workshop on “Open Shell Compounds and Molecular Spin Devices”, November 10-13, 2019, Awaji Island, Japan., 2AM09
D. Mazhukin, E. Zaytseva, Y. Ten, D. Shiomi, Y. Gatilov, A. Yu, K. Sugisaki, A. Bogomyakov, K. Sato, T. Takui, E. Bagryanskaya
New trends in the chemistry of hybrid phenoxyl-nitroxides
the 13th Japanese-Russian Workshop on “Open Shell Compounds and Molecular Spin Devices”, November 10-13, 2019, Awaji Island, Japan., 2AM06
D.A. Morozov, S.A. Dobrynin, Yu.I. Glazachev, I.A. Kirilyuk
2,2,5,5-Tetraethyl substituted pyrroline nitroxides: Synthesis and 3PM12 transformations
the 13th Japanese-Russian Workshop on “Open Shell Compounds and Molecular Spin Devices”, November 10-13, 2019, Awaji Island, Japan., 3PM12
V.M. Tormyshev, O.Yu. Rogozhnikova, D.V. Trukhin, T.I. Troitskaya, M.K. Bowman, E.G. Bagryanskaya
Trityl Spin Labels in Distance Measurements in Biomolecules Using SDSL and Pulsed ESR
XIth International Workshop on EPR in Biology and Medicine. Krakow, Poland, October 6-10, 2019, Book of Abstracts, p. 68
K. Sato, R. Hirao, I. Timofeev, O. Krumkacheva, E. Zaytseva, O. Rogozhnikova, V. Tormyshev, D. Trukhin, E. Bagryanskay, T. Gutmann, V. Klimavicius, G. Buntkowsky, K. Sugisaki, S. Nakazawa, H. Matsuoka, K. Toyota, D. Shiomi, T. Takui
Multi-Frequency EPR/ENDOR, DNP and AWG Pulse MW Spectroscopy of g-Engineered Trityl-Aryl-Nitroxide biradicals
Int. Conference "Magnetic Resonance - Current State and Future Perspectives" and satellite XXI International Youth Scientific School "Actual problems of magnetic resonance and its application", September 23-27, 2019 Kazan, Russia, , Book of Abst. P. 173
E. Zaytseva, I. Timofeev, O. Krumkacheva, D. Parkhomenko, D. Mazhukin, K. Sato, H. Matsuoka, T. Takui, E. Bagryanskaya
EPR and DEER characterization of new mixed weakly coupled nitroxide triradicals for molecular three-spin qubits
International conference ORGEL-2019, 23-29 Sept., Novosibirsk, Russia, Book of abst. PP-45, page 101
K. Sato, R. Hirao, I. Timofeev, O. Krumkacheva, E.V. Zaitseva, V.M. Tormyshev, D.V. Trukhin, O.Yu. Rogozhnikova, D.A. Parkhomenko, E. Bagryanskaya, T. Gutmann, V. Klimavicius, G. Buntkowsky, K. Sugisaki, Sh. Nakazawa, H. Matsuoka, K. Toyota, D. Shiomi, T. Takui
Trityl-Aryl-Niroxide Based Genuinely g-Engineered Biradicals, as Studied by DNP, Multi-Frequency ESR/ENDOR, AWG Pulse MW Spectroscopy and Quantum Chemical Calculations
International conference ORGEL-2019, 23-29 Sept., Novosibirsk, Russia, Book of abst. PP-39, page 95
D.l. Polyukhov, A. Poryvaev, M. Fedin
Precise Measurements and of effective window sizes of ZIF-8 monitored by Electron Paramagnetic Resonance
International conference ORGEL-2019, 23-29 Sept., Novosibirsk, Russia, Book of abst. PP-20, page 76
E. Zaytseva, D. Shiomi, Yu. Ten, Yu. Gatilov, D. Stass, A. Bogomyakov, A. Yu, K. Sugisaki, K. Sato, T. Takui, E. Bagryanskaya, D. Mazhukin
Magnetic properties of π-conjugated phenoxyl-nitroxide radicals as designed for advanced molecular magnetism
International conference ORGEL-2019, 23-29 Sept., Novosibirsk, Russia, Book of abst. O-1, page 38
M.K. Bowman
Electron Spin Relaxation and Motion in Solids: Spin, Spatial, Spectral
Int. Conference "Magnetic Resonance - Current State and Future Perspectives" and satellite XXI International Youth Scientific School "Actual problems of magnetic resonance and its application", September 23-27, 2019 Kazan, Russia, , Book of Abst. P. 22
А.И. Таратайко, Е.В. Зайцева, С.А. Добрынин, И.А. Кирилюк
Синтез профлуоресцентных нитроксильных радикалов – потенциальных зондов для биофизических исследований
Сборник тезисов докладов V Междисциплинарной конференции «Молекулярные и Биологические аспекты Химии, Фармацевтики и Фармакологии», Судак, Крым, РФ, 15-18 сентября 2019 года, С. 233
С.А. Добрынин, Е.В. Зайцева, И.А. Кирилюк
Стереоэлектронные эффекты в нитроксильных радикалах пирролидинового ряда
Сборник тезисов докладов V Междисциплинарной конференции «Молекулярные и Биологические аспекты Химии, Фармацевтики и Фармакологии», Судак, Крым, РФ, 15-18 сентября 2019 года, С. 146
A.I. Taratayko, S.A. Dobrynin, E.V. Zaytseva, I.A. Kirilyuk
2-Functionalized sterically shielded pyrrolidine nitroxides
the 13th Japanese-Russian Workshop on “Open Shell Compounds and Molecular Spin Devices”, November 10-13, 2019, Awaji Island, Japan., 3PM11
O.Yu. Rogozhnikova, D.V. Trukhin, T.I. Troitskaya, M.K. Bowman, E.G. Bagryanskaya, V.M. Tormyshev
Persistent tris(tetrathiaaryl)methyl radicals - a new generation of spin labels designed for studying the structure of biopolymers
XXI Mendeleev Congress on general and applied chemistry. Saint Petersburg 9-13 September, 2019.Book of abstracts. Volume 1, Section 1, Page 256
P.A. Fedyushin, L.Yu. Gurskaya, E.V. Panteleeva, T.V. Rybalova, E.V. Zaytseva, E.V. Tretyakov
Exploration of SN F -approach toward functionalized nitroxides and nitronyl nitroxides
Book of abstracts of XI International Conference on Chemistry for Young Scientists. Saint Petersburg (September 9-13, 2019), P. 243
S. Zhivetyeva, P.V. Petunin, P.S. Postnikov, I.Yu. Bagryanskaya, E.V. Zaytseva, E.G. Bagryanskaya, E.V. Tretyakov
First exchange-coupled verdazyl-nitroxide diradical: synthesis, structure and magnetic properties
Book of abstracts of XI International Conference on Chemistry for Young Scientists. Saint Petersburg (September 9-13, 2019), P. 154
С.С. Овчеренко, А.В. Шернюков, О.А. Чинак, Е.Г. Багрянская
Изучение свойств проникновения фрагмента к-казеина RL2 внутрь клеток человека
В книге: Биотехнология - медицине будущего Материалы всероссийской мультиконференции с международным участием. Новосибирск, 2019. С. 199.
С.С. Овчеренко, А.В. Шернюков, О.А. Чинак, Е.Г. Багрянская
Изучение структурных и агрегационных свойств фрагмента K-казеина RL2
В книге: Биотехнология - медицине будущего Материалы всероссийской мультиконференции с международным участием. Новосибирск, 2019. С. 198.
I.O. Timofeev, A.S. Spitsina, N.Sh. Lebedeva, O.I. Koifman, A.S. Chubarov, M.V. Fedin, E.G. Bagraynskaya, O.A. Krumkacheva
EPR studies of complexes of photosensitizers with albumin promising in photodynamic therapy of cancer
В книге: Биотехнология - медицине будущего Материалы всероссийской мультиконференции с международным участием. Новосибирск, 2019. С. 139.
С.С. Куцейкин
Получение контрастных агентов для 1H магнитно-резонансной томографиина основе человеческого сывороточного альбумина инитроксильных радикалов
В книге: Химия материалы 57-й Международной научной студенческой конференции. Новосибирск, 2019. С. 71.
Ю.В. Хорошунова
Синтез и модификации нитроксильных радикалов со спиро-2'-гидроксиметилциклопентановым фрагментом
В книге: Химия материалы 57-й Международной научной студенческой конференции. Новосибирск, 2019. С. 60.
E. Zaytseva, Yu. Ten, Yu. Gatilov, Ai. Yu, D. Mazhukin, E. Bagryanskaya
Hybrid Phenoxyl-Nitroxide Radicals as a New Building Block in Magnetochemistry
The 52nd Annual International Meeting of the ESR Spectroscopy Group of the Royal Society of Chemistry, April , 7- 11, 2019, Glasgow, UK, Book of Abst., P1.

Патенты

С.А. Добрынин, Ю.В. Хорошунова, И.А. Кирилюк
Способ получения 2,2,5,5-тетраэтил-3-карбоксипирролидин-1-оксила
Заявка 2019119971, приоритет от 25.06.2019, Патент RU 2 702 331 , Бюл. № 28, опубликовано: 08.10.2019

Расширения для Joomla